Cet exercice a pour préalable d’avoir installé R et RStudio. Se familiariser avec l’interface Ouvrez RStudio. Vous devriez voir l’interface comme à l’image ci-dessous, pour l’heure sans la partie A. La partie C est en principe vide: Les fonctions de ces différentes parties sont les suivantes: Exécutez des lignes de codes dans la console (B) […]
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Installer R et RStudio comme logiciels indépendants
R est un langage de programmation. Pour que les programmes écrits en R fonctionnent, il est nécessaire d’installer au préalable un environnement d’exécution pour ce langage. RStudio est un environnement de développement (en anglais: IDE: Integrated development environment) pour R. Installer l’environnement d’exécution du langage de programmation R Vous pouvez installer R et RStudio comme […]
Installer R, RStudio et Orange Data Mining avec Miniconda
Conda est un gestionnaire de logiciels d’analyse de données et de visualisation extrêmement répandu dans les milieux scientifiques. Sa version minimale, Miniconda, permet d’installer et de tenir à jour plusieurs logiciels dont R, RStudio et Orange Data Mining. Installez-le en suivant les instructions ci-dessous. Dans tous les cas, si un choix est proposé choisissez la […]
Create a subgraph from the neighborhood of specific vertices in igraph
Many user of igraph for R expect the functions ego() and make_ego_graph() , that take a list of vertices as input, to generate a new graph composed of the neighbors of these vertices. Unfortunately, these functions do no such thing. They generate a list of igraph.vs objects, which cannot be further treated as an igraph […]
Visualiser des données avec R (2): réductions dimensionnelles et clustering
Cet exercice fait suite à l’exercice Visualiser des données avec R (1). Il présuppose que vous avez chargé les données et créé les variables de cet exercice précédent, faute de quoi les scripts R ci-dessous ne fonctionneront pas. Les commentaires du code sont minimaux. Cet exercice présuppose soit, 1. que vous venez de suivre une […]
Unknown column? Force encoding of an entire table from “unknown” to “UTF-8” in R on Windows
A common knitr issue on Windows Running R scripts on a Windows machine is equivalent to a dive into enconding hell. In effect, your non-English data most likely contains characters like Ä, ü, è or š, or even 语言. In all cases, the only serious way of dealing with these, in fact with any data […]
Cleaning up PDFs of pre-1990s scanned texts for text mining in R with Quanteda
Text sources are often PDF’s. If optical character recognition (OCR) has been applied, the pdftools R package allows you to extract text from all PDFs to text files stored in a folder. The readtext package converts the set of text files into something useful for Quanteda. Nevertheless, some cleaning is necessary before transforming your text […]
Stacked histogram with bivariate colored bars in R
A histogram gives you counts of elements within spefic ranges of a variable, represented as bars. Sometimes, you want to see more than bars. The following code allows you to represent a second variable with a color shade:
Cartographie avec R
Les instructions de ce document sont encore valables, mais l’univers des modules R a beaucoup évolué depuis 2016. Aujourd’hui, les principaux développements en matière de données vectorielles se sont détachés des 3 anciens modules documentés ci-dessous (sp, rgdal, rgeos) pour se reposer principalement sur le modules sf. Pour une version mise à jour de cet […]
Visualiser des données avec R: barchart, boxplot, bubblechart 3D, histogramme, parallel coordinates, radar chart, stripchart
Cet exercice vous conduit à travers le processus de visualisation de données dans R. Il présuppose que vous connaissez déjà les bases de maniement de R et de RStudio. Charger les données Téléchargement Téléchargez le fichier unine_exercice1.zip depuis le site du cours. Décompressez le contenu de l’archive zip dans un dossier de votre choix, par […]